У рассматриваемого мной для примера сотрудника все эти условия соблюдаются, но он все равно попадает во входящее сальдо.

Тогда остается только через отладчик смотреть, почему данный сотрудник попадает в документ.

Попробую. Вариант наличия ошибки у вас вы не рассматриваете? Таких сотрудников предположительно больше тысячи.

megasoft

Попробую. Вариант наличия ошибки у вас вы не рассматриваете? Таких сотрудников предположительно больше тысячи.

Не исключена ошибка и в алгоритме выгрузки.

Похоже ошибка в вашем алгоритме. На втором этапе сначала сотрудник добавляется в список, а уже потом перебираются его начисления, которых может и не быть. Логичнее было бы делать наоборот - сначала смотреть, есть ли начисления, а потом добавлять сотрудника в список.