Ответ поддержки: Для возможности удержания по исполнительным листам при выплате за первую половину месяца, нужно сформировать Табель за первую половину месяца. Далее рассчитать документ «Расчет исполнительных листов», в котором будет указана базовая сумма из Табеля и рассчитан НДФЛ, предварительно в настройке установить флаг «учитывать НДФЛ, рассчитываемый при выплате в текущем месяце». После этого произвести выплату заработной платы за первую половину месяца, в настройках документа необходимо установить флаг «за вычетом удержаний, выплат», указать период и удержание.
Но! Это учитель и з/п начисляется из расчет педагогической нагрузки. Поэтому расчет не корректный, база только из табеля. 
Есть ли возможность добавлять и расчет пед нагрузки? 

Ответ оказался простым: не делать ссылку на документ, как советовала поддержка.