Добрый день.
Программа будет предоставлять с того месяца, с которого вы назначите.
О правомерности предоставления правильнее уточнить в ИФНС. Т.к. письма с разъяснениями выпускают, но каждый их "читает" по разному. У налогового агента должно быть подтверждение ФНС.
Например, Письмо ФНС России
от 11.01.2024 № ЗГ-2-11/213
В письме ФНС России от 11.01.2024 № ЗГ-2-11/213 рассмотрела вопрос о предоставлении вычетов за месяцы, когда у сотрудника не было дохода, облагаемого по ставке 13 %. По мнению ведомства, вычет по НДФЛ нужно предоставить в последующих месяцах, в которых такой доход появится, в том числе за те месяцы, в которых не было выплат.Отметим, что этот вывод ФНС России не универсален, такой подход не следует применять в следующих ситуациях. Если выплата доходов с какого-то месяца полностью прекращена и не возобновляется до окончания года, вычет за такие месяцы работнику не положен (письмо Минфина России
от 30.10.2018 № 03-04-05/78020
).Кроме того, если у сотрудника не было дохода, облагаемого НДФЛ, с начала года и налоговая база по НДФЛ работодателем не определялась, то вычеты следует предоставить с того месяца, в котором сотрудник начинает получать облагаемый НДФЛ доход. Например, если сотрудница выходит из отпуска по уходу за ребенком, то право на детский вычет по НДФЛ она получит с месяца выхода на работу, а не с начала года (см. письма Минфин России
от 26.12.2014 № 03-04-05/67642
,
от 11.06.2014 № 03-04-05/28141
).