Добрый день.
Исходя из п. 3.4 Приложения № 4
Порядка заполнения формы персонифицированных сведений
, данные об ИНН физического лица заполняются при наличии, т.е. не являются обязательным реквизитом формы отчетности. В таблице 4.9 Приложения № 6 к Порядку заполнения формы элемент «ИНН» как часть персональных данных физлица прямо помечен признаком обязательности «Н» — «наличие элемента в файле обмена необязательно, то есть элемент может отсутствовать». Таким образом, внесение корректировок не требуется.
Уточните в ИФНС, в каком виде предоставить паспортные данные по сотруднику, скорее всего ответ в свободной форме и скрин паспорта. Не забывайте о соблюдении правил о персональных данных сотрудника.