До разделения и реорганизации в предприятии учет зарплаты вели в
централизованной бухгалтерии в
Камин Зарплата ПРОФ 5.0.

После разделения и сокращения персонала приобрели
Камин Зарплата 5.0 Базовая версия.

Как конвертировать Камин Зарплата 5.0. ПРОФ в Камин Зарплата 5.0. Базовая?

Попробуйте сделать так:
1. Конфигурация - Поддержка - Настройка поддержки - Снять с поддержки
2. Конфигурация - Загрузить конфигурацию из файла. Здесь указать cf того же номера релиза базовой конфигурации, что и используемая ПРОФ.