Здравствуйте! В мае 2017 сотрудник предоставил уведомление о предоставлении имущественного вычета. Через документ корректировка введены данные уведомления и необлагаемая сумма дохода. Программа с мая перестаёт удерживать НДФЛ и делает перерасчет возврата с минусом т.е. появляется излишне удержанный НДФЛ. Сотрудник пишет заявление на возврат налога. Как осуществить возврат налога с отображением его в налоговом регистре, в отчетах 6-НДФЛ и 2-НДФЛ?

В документе НДФЛ поставить галочку в настройках документа о возврате.

Это я сделала, поэтому и возник расчет с минусом. Как быть дальше? 6-НДФЛ формирует после проведения выплаты строку 90. 2-НДФЛ показывает сумма налога удержанная, хотя её там не должно быть. В налоговом регистре программа показывает удержанную сумму и её же как излишне удержанную. Откуда появилось это удержание, если возврат прошёл через выплаты (в части удержанного НДФЛ с минусом) и перечисление НДФЛ с минусом?

В первой выплате после возврата НДФЛ документом НДФЛ на закладке удержанный НДФЛ и расчет НДФЛ, должны появиться суммы возврата НДФЛ. Если их там нет, то нужно следить за периодом рассчитанного НДФЛ и сделать перерасчет документа, а то и удаление строки из документа с этим сотрудником.