Здравствуйте! Ни как не могу настроить программу, чтобы она правильно заполняла 6-НДФЛ. Дело в том
, что иногда при выплате аванса возникает переплата (если работник например ушел в отпуск без содержания), следовательно зарплата не выплачивается и не удерживается НДФЛ, но при выплате аванса в следующем месяце мы обязаны удержать и оплатить ндфл. В программе почему то этот момент не реализован.., ввод корректировки НДФЛ исчисленного на дату оплаты аванса ничего не дает и в документе "выплата аванса" НДФЛ не заполняется.. Очень жду ответа!
Привожу пример как должно быть: Оклад работника составляет 68 000 руб., в т.ч. НДФЛ 13 % — 8 840 руб. Аванс за июль был выплачен 19.07.2016 в размере 27 000 руб. Оставшаяся сумма 41 000 руб. без уменьшения на величину НДФЛ (68 000 руб. – 27 000 руб.) была выплачена 28.07.2016. Следующая выплата была произведена 19.08.2016 (аванс за август 2016 года) в размере 18 160 руб. (27 000 руб. – 8 840 руб.), т. е. аванса, уменьшенного на неудержанный при предыдущей выплате НДФЛ.
Строки 100 – 140 формы 6-НДФЛ в части досрочно выплаченной июльской зарплаты будут заполнены так:

строка 100 «Дата фактического получения дохода» — 31.07.2016;
строка 110 «Дата удержания налога» — 19.08.2016;
строка 120 «Срок перечисления налога» — 22.08.2016;
строка 130 «Сумма фактически полученного дохода» — 68 000;
строка 140 «Сумма удержанного налога» — 8 840.

На практике при досрочной выплате остаток зарплаты выдается уже без учета НДФЛ. В любом случае перечислять налог с зарплаты за текущий месяц, выданной до конца этого месяца, нужно не ранее дня ближайшей выплаты, которая будет произведена уже в следующем месяце. (основание: Письмо ФНС от 16.05.2016 № БС-3-11/2169@)

?

Ответ был дан ранее по электронной почте, дублирую ответ и сюда.
С Вида операции Выплата аванса НДФЛ не удерживается, но если вам нужно именно в дату аванса удержать НДФЛ то для данного сотрудника вы можете создать документ Выплата с Видом операции Выплата зарплаты.