Имеем:
1С-КАМИН:Зарплата. Версия 5.0 (5.0.25.


Иванова работала в 2015 году с начала года по основному месту работы и имела две льготы на детей.
30.10.2015 - уволена.

02.11.2015 - принята на работу по совместительству, соответственно, без льгот.

Проблема:
При расчете НДФЛ в октябре расчет НДФЛ рассчитывается нарастающим итогом, но уже без учета предоставленных ранее вычетов.

Как решить данную проблему?

Для начала обновитесь до текущего релиза. Возможно Ваша проблема исчезнет сама собой.