Организация оплатила учебу за  физ лицо. Физ лицо не работает в организации. Как отразить  это в камине, чтоб ндфл был верный?

Добрый день.
Если физлицо не работает в организации, значит и удержать будет невозможно. 
Вы можете создать сотрудника в справочнике, не принимать на работу. Создать документ Прочий доход. Скорее всего установить настройку Невозможно удержать. Затем отразить в 6НДФЛ годовом в справке 2НДФЛ о невозможности удержания.