Здравствуйте! Подскажите, пожалуйста. Сумма доходов на январь меньше чем стандартный вычет, как в программе настроить перенос остатка неудержанного НДФЛ на февраль. 

Добрый день.
Если вы установили настройку Возвращать излишнеудержанный, значит сумма налога стала отрицательной. Если она отрицательная, значит считается возвратом.
В выплате зарплаты на закладке Удержанный НДФЛ будет заполнена как отрицательная сумма и установлен флаг Возврат.
Затем сумма будет отражена в 6НДФЛ как возврат в 030х строках.