У нас было также, помогло документы по Выплате "выплата за первую половину месяца" распровести, полностью очистить табличную часть, затем снова заполнить и провести. Минуса исчезли.
Релиз конфигурации 5.0.91.4 со всеми исправлениями (патчи вышли после 20 января, поэтому надо старые документы Выплата переделывать полностью).