Добрый день. В больничный тянет ГПХ, Где проверить и отключить?

Добрый день! Опишите проблему конкретнее.

Куда тянет? Если в базу для расчета, то зайдите в справочник Виды начислений - Больничный лист за счет работодателя - Вкладка "База". Исключите оттуда ненужные начисления, в частности вознаграждения по договорам ГПХ. Тоже самое сделайте для Вида начисления - Больничный (за счет ФСС).