После обновления в "Свод отчислений и налогов" у сотрудников лезут отрицательные суммы. В регистре сведений Страховые взносы у них тоже стоят отрицательные суммы. Это военнообязанные сотрудники и в начислениях у них стоит что не облагаются страховыми взносами. Как исправить

Прикрепляю два файла один за октябрь где все нормально другой за ноябрь(уже после обновления)

У вас и в октябре проблемы... по столбику "всего начислено" тоже не должно быть минусов. Вообще аттестованных в этом своде не должно быть (кроме стажеров). Для начала распроведите документы "конец месяца" за октябрь и ноябрь. Затем последовательно сначала рассчитайте и проведите конец октября, затем конец ноября. Судя по тому, что по расчету вам свод показыаает пусто, то манипуляции с концами месяца должны помочь.

А еще, судя по своду, у вас раньше неправильно в справочнике начислений было настроено обложение зп аттестованных. И концы месяца вам надо пересчитывать с января. Судя по цифрам в столбике "начислено" по проводкам - это зп за 11 месяцев