Собственно сами фишки расчета по среднему (3.5.44.7) - не попадитесь как я ))

1
Если выбрать "предоставить мат.помощь" и заполнить появившуюся вкладку, то при расчете взносов в ПФР и прочие фонды вычет по матпомощи в размере до 4000 руб/год не применяется.
Лечится начислением матпомощи к отпуску отдельным документом

2
Создаем документ расчет по среднему
Рассчитываем командировочные, с включенным признаком "исключать неоплачиваемые выходные и праздничные дни из командировки" на вкладке "Дни командировки"
Копируем этот сохраненный документ (F9). Заходим в помощник и считаем отпускные
Сохраняем - в регистр "Время неотработанное" записывает несколько периодов, соответствующих только рабочим дням, количество нерабочих дней указывает равным 0
Лечится только переключением в расчет командировочных, отключением вышеуказанного признака и переключения обратно в расчет отпускных