Как утверждает бухгалтер раньше (в предыдущих релизах) он ставила в настройках коэффициент 1 и программа выводила в таблицу одинаковые суммы начисленного и уплаченного, сейчас даже если поставить коэффициент 1 суммы разные, у большинства.
Куда смотреть?

При формировании сведений СЗВ 6-4, на закладке Настройка поля "Начислено по организации", "Уплачено по организации" совпадают с РСВ-1 за текущий период? "В том числе доплата за предыдущий период" соответствует строке 150 РСВ-1 за предыдущий период?

отослал вопросы бухгалтеру - пусть проверит

Выше указанная тема также волнует бухгалтера по з/п. Раньше выставленная сумма оплаты (рассчитывался коэффициент ниже) автоматом сумма распределялась по всем работникам. Теперь недоумевает как её распределить? Руками каждому забивать долго и можно ошибиться. Подскажите как выйти из сложившейся ситуации. Также интересует вопрос первоначальных остатков долга за предыдущий квартал. С ПФР они не идут и постоянно приходиться корректировать в ручную ..

Боюсь, придется Вам лопатить все файлы с 2010 года - где-то что пропустили: или документ не проведен, или отсутствует в Вашей базе, или дважды занесен.
Но, самый простой вариант - взять отчет со статистикой в ПФР в электронном виде и загрузить его в Вашу базу с помощью помощника, а все документы СЗВ отменить проведение.

Только в случае внесения правильных остатков можно получить корректное распределение сумм Уплачено по сотрудникам. Для ввода остатков можно воспользоваться документом «сведения» с помощником «загрузка данных по начисленным и уплаченным взносам в ПФ РФ». Есть возможность ввода остатков из файлов XML отчетности, сданных в ПФ. Есть возможность ввода остатков из файла XLS – сверки с Пенсионным Фондом (можно получить по запросу в своем отделении ПФ РФ), также можно внести остатки в ручную по каждому сотруднику. Если Вы заносите остатки на начало отчетного периода, документы "Сведения" за периоды, предшествующие отчетному, нужно сделать не проведенными.