Добрый день! сотрудникам будет выплачиваться премия по итогам года. Получается с этой премии должен удержаться ндфл, но руководство хочет чтоб суммы были ровные 1000р.;2000р.Можно ли удержать ндфл как бы "сверху". А при расчете з.п. эти суммы перекрылись. Подскажите!!!

А в чём проблема-то?
В приказе начисляете премию не 1000, а 1000 : (1 - 0,13) = 1150=
Или, соответственно, 2300=. И т.п.
Ошибки округления ("рупь туда -- рупь сюда") сгладятся при расчёте НДФЛ за месяц (за декабрь).

P.S. Могут быть "приятные неожиданности" для тех, у кого вычеты больше дохода (например, есть ребёнок-инвалид). Но, я думаю, таким работникам можно эти 150-300 рублей и подарить (особо не афишируя; тем более, что этот "подарок" -- за счёт налогов).