У сотрудника был больничный в январе 2016. НДФЛ рассчитался в отдельной вкладке. Сумма НДФЛ с больничного – 1064 руб.

Вроде бы все хорошо, но теперь при расчете зарплаты за последующие месяцы, программа выдает сумму НДФЛ, начисленную с того больничного, двумя строками – одну и ту же сумму с минусом и с плюсом. – 1064 и +1064
Подтверждаю все фотографиями, потому что словами объяснить очень сложно.
Не могу понять, что мы сделали не так. Почему эти суммы выходят каждый месяц?
Привела один такой пример, но на самом деле так происходит со всеми сотрудниками, которые были на больничном.

Не хватает скрина документа НДФЛ за январь и апрель

...

Сложновато по скринам понять, тем более что вы затираете ФИО )).
Попробуйте на копии распровести документы НДФЛ и выплаты, а затем рассчитать НДФЛ и нажать кнопку "обновить" на закладке "Удержанный НДФЛ" в документах выплат, и провести их в хронологическом порядке, отслеживая, какой период НДФЛ у Вас стоит на закладке "Удержанный НДФЛ" в выплатах.
Чаще всего проблема заключается в том что сначала сделали начисление на одну статью/подразделение/место работы, посчитали НДФЛ, выплатили. А потом в начислении изменили статью/подразделение/место работы. А НДФЛ сам начинает перекидываться между статьей/подразделением/местом работы

На том сотруднике, по которому у нас вопрос, везде стоит курсор (выделено синим) и первые буквы не затерты именно по нему, поэтому с этим не должно быть путаницы. Если это имеет большое значение, то я могу убрать редактирование картинки.

Подразделение везде одно и то же. (

Мне кажется, что дело в месяцах начисления и выплаты НДФЛ. Хотя, может быть и нет.