Добрый день!
Ситуация: в течение марта сотруднику были рассчитаны и выплачены отпускные, удержан и перечислен в бюджет НДФЛ.
29.03.2016 сотрудник приносит уведомление из налоговой на имущественный вычет. Мы применяем это уведомление начиная с доходов марта.
Т.о., НДФЛ удержанный с отпускных удержан излишне.
как корректно отразить описанную ситуацию в программе?

Если напротив дохода 2012 не было бы "галки" НДФЛ рассчитывать при выплате - сложностей не возникло бы.

В выплате зп в настройках поставьте галку "возвращать излишне удержанный Ндфл".