Обнаружил, что при заполнении табеля (не через помощник, а непосредственно из формы) не проставляются отработанные дни, если у человека был отпуск, а потом через корректировку отпуска его отменили. Причем при заполнении через помощник этот момент учтен, и дни ставятся правильно.

Здравствуйте.

Такой режим работы с документом не учитывает корректировку отпуска. Для учета корректировок необходимо пользоваться помощником заполнения документа.
Вносить изменения в этой части конфигурации не планируется.