В документе "Начисл. простое" выделяем оплату за нерабочие дни. После этого суммы за эти дни не попадают в свод универсальный по начисл. и удержаниям. Показываются только суммы по отработанному времени. Даже если поставить галку "Время неотраб." и указать этот вид времени, то само время в отдельном столбце показывается, а суммы за него в столбец соответствующего начисления не попадают. Релиз 3.0.107.2.

Ситуация смоделирована на релизе 3.0.107.3, ошибка не повторилась.
Информации недостаточно. Нужно посмотреть настройки документа начисления, возможно перепровести документ.
Дозванивайтесь на ЛК (4842)27-97-44 с 09:00 до 17:00 по МСК.
Предварительно на компьютер установите ПП удаленного доступа Ammyу Admin или TeamViewer 9.
Или высылайте вашу информационную базу на эл.адрес: hotline@kaminsoft.ru.