Уточню по поводу продажи и поддержки:
1. Программа будет и дальше продаваться, но по другой цене и только по запросу от партнеров или клиентов в фирму КАМИН.
2. Поддержка будет осуществляться в том же объеме, что и раньше.

Что касается перехода на другую конфигурацию, то я бы порекомендовал 5.0, чисто из-за того, что продукт на последней версии платформы и будет активно развиваться. Но в любом случае, сначала надо определиться по функционалу, какая конфигурация больше подходит.

Если речь о бюджетной организации, то однозначно 3.5.
Если речь о хозрасчетной организации, то или 4.0 или 5.0.
Единственными, на мой взгляд, недостатками 5.0 по сравнению с 4.0 является отсутствие смешанной системы налогообложения и менее гибкая настройка прав. В дальнейшем предполагается эти недостатки устранить.