Здравствуйте. В одном подразделении работают сотрудники из разных поселений. Как организовать раздельный учет НДФЛ.

Здравствуйте.

В поле "код по ОКТМО" в отношении организации указывается код муниципального образования, на территории которого находится организация или ее обособленное подразделение (письмо ФНС России от 28 августа 2019 г. № БС-4-11/17090@). То же указано в ПРИКАЗе от 15 октября 2020 г. N ЕД-7-11/753@ "О заполнении формы 6-НДФЛ".
В программе ОКТМО можно задать по организации или по обособленному подразделению.