На последних релизах (возможно начиная c 5.0.62.2) при автоматическом обновлении конфигурации стала происходить ошибка. В логах это выглядит так:

03.04.2020 11:10:11 {OK} Выполнение обработчиков обновления (1/1)...
03.04.2020 11:10:12 {OK} Запускается: wscript.exe; параметры: "C:\Users\andrey\AppData\Local\Temp\22\1Cv8Update.200403110905\add-delete-patches.js" /ConnectionString:"File='F:\BASE1C\1cv8\Zpl\2018_';Usr='Администратор';Pwd='******';UC=ПакетноеОбновлениеКонфигурацииИБ" /COMConnectorName:"v83.COMConnector" /FixFileNames:"" /RemoveFixNames:"" /Out:"C:\Users\andrey\AppData\Local\Temp\22\1Cv8Update.200403110905\templog.txt"; окно: SW_HIDE; ожидание: true
03.04.2020 11:10:45 {ERR} Исключение в runApp: Error, Разрешение отклонено.

В чем может быть причина?

Проверил обновление с 5.0.62.6 на 5.0.62.8 прошло успешно.
Какая версия платформы используется?
Попробуйте переустановить платформу.
Так же можно попробовать вручную зарегистрировать v83.COMConnector через командную строку

Сегодня обновлял на 8.3.16.1296 с 5.0.62.2 на 5.0.62.8. "Разрешение отклонено" это о чем? Кем отклонено? На уровне 1С или ОС? 1С и ОС 64 разрядные. База файловая.

Про разрешение говорится в логе, кусок которого приведен в первом посте. Внешне именно этот момент вообще никак не проявляется - конфигурация нормально обновляется, но при первом запуске говорит, что произошла ошибка обновления. Архивную копию делаю сам, поэтому при обновлении говорю, что делать копию не надо. Если бы не это, то думаю произошло бы восстановление из копии из-за этой ошибки.

Похоже во всем виноват антивирус "360 Total Security". На запуск конфигуратора для обновления конфигурации из скрипта не реагировал, а запуск add-delete-patches.js блокировал.