Добрый день! После обновления версия 4.0.40.3 и 4.0.40.5 стал неверно начисляться и отражаться в регистрах НДФЛ .
А именно:
1.При начислении отпускных ( документ начисление по среднему) и зарплаты (документ табель) по одному и тому же работнику в январе предоставляется стандартный налоговый вычет дважды(2800) вместо одного раза(1400). При этом отпускные не попадают в регистр налогового учета по НДФЛ за 2016 год.
2. В отчете свод отчислений и налогов за январь 2016 в столбце по НДФЛ не находит отражение сумма начислений больничных и компенсации отпуска (шифры доходов 2012 и 2300) в облагаемой сумме и сумме налога.
До этих обновлений НДФЛ отражался и начислялся правильно. Просим оперативно принять меры по устранению вышеописанных проблем.
С 2016 года по НДФЛ квартальная отчетность. Необходимо, чтобы регистры заполнялись правильно.

С уважением, Гл.бухгалтер Дубовик Г.В.

Это не ваш случай? - С 2016 года изменился порядок расчета и удержания НДФЛ по некоторым видам дохода, таким как больничные, отпуска, материальная помощь