Добрый день, подскажите такую ситуацию есть сотрудник он с октября на больничном, дохода у него нет а стандартные вычеты ему предоставляются в конце месяца, соответственно база начислений не увеличивается а вычеты по нарастающей увеличиваются и за ноябрь и декабрь лезут минусы на сумму предоставленного вычета, что делать с ними в конце года?

В конце года отрицательный НДФЛ следует вернуть работнику (в декабре в документе НДФЛ должен быть соответствующий флажок).