оклад по чину был заведен (давно) как постоянная надбавка (раньше он был как % от оклада, теперь - фиксированная сумма).
Документ изменение ставок проведен, всё выглядит красиво, однако при расчете табеля использует старое значение надбавки за классный чин (сам оклад - новый). 
чины у сотрудников есть, оклады в справочнике "классные чины" проставлены.
Как правильно завести оклад по чину чтобы проходила индексация, а не менять его каждому сотруднику вручную)? 

Добрый день.

В кадровых документах (Прием, Изменение) при установке флажка "государственная служба" будет доступна соответствующая закладка, на которой устанавливается Оклад по чину.