На нашем предприятии задержки по выплате заработной платы, за 1-ый квартал зарплата не выплачена, но начислена. Каким образом заполняется в этом случае раздел2 6-НДФЛ. Если его вообще не заполнять, то при выгрузке выдается ошибка "Содержимое элемента "ДохНал" является неполным. Список ожидаемых элементов: "СумДата", т.е. требуется заполнить сумму и дату налога, а его нет. Если заполнить даты фактического получения дохода и сумму фактического дохода (31.01.2016, 29.02.2016, 31.03.2016 г. с суммами), то также выдается ошибка, требуя заполнить даты удержания налога, суммы налога. Как в этом случае заполнять 2 раздел 6-НДФЛ???

Раздел 2 должен быть заполнен, иначе файл не пропустит.
Если нет выплаченных сумм, то в раздел 2 добавьте строчку например 31.03.2016, 31.03.2016, 31.03.2016, 0, 0.

Если заполнить хоть какие-то данные в разделе 2, то тогда также выдается ошибка с требованием заполнить все недостающие строки. Что делать?

20001000781

выдается ошибка с требованием заполнить все недостающие строки.

Какие еще недостающие строки? Можно чуть более конкретней.
Для "нулевого файла" достаточно строки раздела 1 со ставкой "13" и нулями.
И раздела 2 с одной строкой, в которой заполнены даты и нулевые суммы.
Проверял такой файл онлайн-проверкой, пропускает.

Заполняю 1 Раздел 6-НДФЛ с суммами, т.к. они действительно есть, показываю сумму дохода, налога начисленного и не удержанного, во 2-ом Разделе заполняю даты 31.01.2016. 29.02.2016, 31.03.2016 без дохода, но с датами удержания и сроками перечисления налога - везде ставлю 31.03.2016, тогла файл проходит. НО, ЭТО ЖЕ НЕПРАВИЛЬНО! Доход же есть, а сроков удержания и перечисления налога на самом деле нет. Получается, что некорректно указаны данные.