Здравствуйте!
По сотруднику, который работал по Основному месту работы и ГПХ, в совпадающий период не берет в СЗВ -стаж период по основному месту работы. По реквизитам в документах не увидели ничего такого некорректного. Подскажите, пожалуйста, в чем может быть причина.

Если оформляется договор на работника организации, то при проведении документа с флажком "добавить запись о стаже" вы получите сообщение:
Период стажа документа пересекается с периодом стажа по основному месту работы. Стаж по договору ГПХ будет автоматически добавлен в документ СЗВ-СТАЖ

При этом в справочнике сотрудники запись о договоре в трудовом стаже будет отсутствовать, а в отчете СЗВ-СТАЖ запись о договоре будет добавлена первой строкой, далее будут записи об основной работе.

Проверяйте в справочнике "сотрудники" - в трудовом стаже есть строки с договором, каким документом они созданы?

В карточке сотрудника присутствуют на закладки Стаж строки по Договору. И документом они созданы Договор.

Отмените проведение документа "договор" и проведите вновь.
Получите сообщение, описанное ранее в моем ответе?
Переформируйте СЗВ-СТАЖ.

Здравствуйте! У данного сотрудника увольнение 18.02.2022, а договор за период с01.02.2022 по 28.02.2022. При перепроведении договора сообщение не выходит.

На текущий момент непосредственно в отчете СЗВ-СТАЖ внесите исправление. Строка с Договором должна быть первой с 01.02. по 28.02, следующая с 01.01 по 18.02.