Да, для этого предназначен механизм синхронизации данных между этими конфигурациями.
Обращаю ваше внимание что при первой настройке синхронизации необходимо выполнить сопоставление объектов (чтобы не "задвоились" данные в справочниках).
Рекомендую ознакомиться с материалами:
1. Документация раздел 12.5.3 Технология обмена данными с программой 1С:Бухгалтерия. Редакция 3.0» и Видеоуроки "70 Синхронизация"