НДФЛ с больничных (так же как и с отпускных, договоров ГПХ, материальной помощи) удерживается в момент выплаты. Таким образом, если вы начислили больничный в январе, а выплачивать будете в ноябре, то и НДФЛ посчитается в ноябре.
Посмотрите на главной странице сайта, очень много полезных ссылок про НДФЛ
www.kaminsoft.ru/service/chastye-voprosy.html