Отличаются ли друг от друга дистрибутивы разных вариантов 4.0? Разные варианты это разные конфигурации или просто в зависимости от пароля включаются разные ограничения? Т.е. если есть база 4.0 лайт, то после апгрейда на 4.0 проф достаточно будет сменить пароль или нужно будет как-то хитро обновлять конфигурацию в базе?

Конфигурации одинаковые.

Т.е. если есть база 4.0 лайт, то после апгрейда на 4.0 проф достаточно будет сменить пароль?

Извините, это значит, что если у меня клиенты на Стандарт, то приехав к тому, у кого Лайт, я смогу обновить его базу? Или мне все-таки надо разделять обновления (это лайт, это стандарт)?

Поле апгрейда достаточно сменить пароль.
Одной конфигурацией можно обновлять и Лайт, и Стандарт, и ПРОФ.