Добрый день!
Подскажите пожалуйста, как правильно рассчитать и учитывать дальше пособие до 1,5 лет, если родилась тройня?

У Вас при расчетах по ФСС применяется зачетная система или пилотный проект ?

В любом случае для расчета пособия Вы работаете с документом 'Начисление по среднему' - с помощником 'Расчет больничного с 2011 года' :
Для расчета пособия необходимо выбрать 'Вид б/л' - 'Отпуск по уходу за ребенком до 1,5 лет', указать полный период отпуска, в котором будет находится сотрудница.
Вам необходимо создать три документа - на каждого ребенка отдельно.

Но суммированный размер пособия, рассчитанный исходя из среднего заработка, не может: превышать
--100 процентов среднего заработка;
-- быть меньше суммированного минимального размера пособия.

По ограничению "100% среднего заработка" автоматического расчета нет.

Если по каждому расчету Вы получили минимальное пособие, то тогда выплата производится именно в этих размерах, даже если суммарное минимальное пособие превышает средний заработок работницы.
Если пособие превышает минимальный размер, то в третьем документе (на третьего ребенка) сумму пособия измените вручную.
Рассчитать сумму на третьего ребенка необходимо так: средний заработок - сумма 1го пособия - сумма 2го пособия.