Релиз 34.5.65,4 В отчете 6 ндфл сумма стандартных вычетов стоит с копейками
Раздел 1 выглядит так: доход 6345160,93 вычеты-321018,55,налог -753423 Т.е. получается,что и сумма налога насчитана неверно
Как исправить? не пойму в чем дело

Предоставленные вычеты могут быть с копейками для сотров, у которых доход за месяц меньше вычетов.
Для анализа есть "Расшифровка".
Хотя с НДФЛ у вас не все красиво: Почему то (6345160,93 -321018,55)*13% не равно 753423.

Сталкивались с подобной проблемой. После обновления на релиз 65.4 бухгалтер решил перепровести межрасчетные выплаты за август, поскольку ошибся на день с датой выплаты. После этого в РН "Фактически предоставленные вычеты" появились записи с дробями, хотя в документах стояла настройка "Не предоставлять стандартные вычеты". В чем проблема, разбираться не стали, просто почистили этот регистр в перепроведенных документах.

Да,да с НДФЛ совсем некрасиво

Сформируйте отчеты-НДФЛ-сравнение рассчитанного и удержанного НДФЛ, период с 01.01 по 30.09, показывать расхождения
И свод НДФЛ с настройками ниже

В отчете :сравнение рассчитанного и удержанного налога никаких расхождений нет А вот в своде НДФЛ с настройками по скрин.есть рахождения Что делать в такой ситуации?

Это индивидуально. Смотреть расчетники по сотрудникам с начала года. Может быть, действительно недоудержали. Еще бывают ситуации, когда проводят корректировки начислений с периодом прошлые года (перепровожу с периодом, совпадающим с датой начисления, в комментарии пишу, за какой период фактически), бывает вычеты предоставляют уволенным (удаляю из документов НДФЛ). Здесь смотреть надо