Если человек работал по 2-м договорам подряда в разных подразделениях, с разными ОКТМО,КПП, то в справках 2-НДФЛ не делается разбивка по подразделениям. Сумма доходов и НДФЛ суммируется.

Дополнение: Если ФЛ не является сотрудником предприятия а работает только по договорам подряда.
Посмотрел в конфигураторе NDFL2_15.ert (90,sp2), подразделения по договорам никак не учитываются,только по ШР.2 ШР.3, в отличии от 6-НДФЛ.

Ольга Николаевна, порадуйте чем-нибудь.

Ни кто Вас не порадует. В 2.0 такой возможности (разбивкой по ОКТМО) не предусмотрено. Нужно переходить на другие ПО, или делать это в Налогоплательщике ЮЛ.